高新技術(shù)企業(yè)認定中，主要風險集中在高新收入、知識產(chǎn)權(quán)、研發(fā)費用、科技人員這四個方面。

政策規(guī)定：高新技術(shù)產(chǎn)品(服務)收入指企業(yè)通過研發(fā)和相關(guān)技術(shù)創(chuàng)新活動，取得的產(chǎn)品（服務）收入與技術(shù)性收入的總和。對企業(yè)主要產(chǎn)品（服務）發(fā)揮核心支持作用的技術(shù)屬于《國家重點支持的高新技術(shù)領域》規(guī)定的范圍。
①高新技術(shù)領域
企業(yè)需正確選擇企業(yè)涉及的高新技術(shù)領域。例如涉及委托加工的企業(yè)，把商品委托加工后收回加價出售，就不屬于自身擁有的具備核心技術(shù)的高新收入。
②高新收入占同期總收入比值
總收入是指收入總額減去不征稅收入，如果企業(yè)其他收入較高，可能會使技術(shù)收入占比不達標，例如投資收益的增加需要關(guān)注。
③主要產(chǎn)品(服務)收入的占比
主要產(chǎn)品（服務）是指高新技術(shù)產(chǎn)品（服務）中，擁有在技術(shù)上發(fā)揮核心支持作用的知識產(chǎn)權(quán)的所有權(quán)，且收入之和在企業(yè)同期高新技術(shù)產(chǎn)品（服務）收入中超過50%的產(chǎn)品（服務）。

二、知識產(chǎn)權(quán)

政策規(guī)定：企業(yè)通過自主研發(fā)、受讓、受贈、并購等方式，獲得對其主要產(chǎn)品（服務）在技術(shù)上發(fā)揮核心支持作用的知識產(chǎn)權(quán)的所有權(quán)；對企業(yè)主要產(chǎn)品（服務）發(fā)揮核心支持作用的技術(shù)屬于《國家重點支持的高新技術(shù)領域》規(guī)定的范圍。

①知識產(chǎn)權(quán)與高新收入之間關(guān)系

知識產(chǎn)權(quán)需與主要產(chǎn)品(服務)密切相關(guān)，對相關(guān)收入具備支撐作用，即需準備科技成果轉(zhuǎn)化的外部證據(jù)。外部證據(jù)包括知識產(chǎn)權(quán)證書、成果鑒定證書、產(chǎn)品驗證報告、技術(shù)評估報告、合同文件等。科技成果轉(zhuǎn)化可以從新產(chǎn)品、新設備、新技術(shù)應用等方面進行展示，每種類型都應準備相應的證明材料。

②知識產(chǎn)權(quán)有效期

知識產(chǎn)品是否為本企業(yè)申報前三年的1月1日起至申報日前獲得。

③知識產(chǎn)權(quán)技術(shù)領域

知識產(chǎn)權(quán)的技術(shù)領域是否屬于《高新技術(shù)領域目錄》。

三、研發(fā)費用

政策規(guī)定：企業(yè)近三個會計年度的研究開發(fā)費用總額占同期銷售收入總額的比例符合要求。

①研發(fā)項目制度

是否建立完善的研發(fā)項目全流程管理制度。

②研發(fā)費用歸集

研發(fā)費用歸集范圍是否準確，與加計扣除口徑差異是否過大。

③研發(fā)費用會計核算

是否設立專用研究開發(fā)費用輔助核算科目和研發(fā)費用輔助帳。

④研發(fā)費用占銷售收入比例

近三個會計年度的研發(fā)費用總額占同期銷售收入總額的比例是否達標。

四、科技人員

政策規(guī)定：企業(yè)從事研發(fā)和相關(guān)技術(shù)創(chuàng)新活動的科技人員占企業(yè)當年職工總數(shù)的比例不低于10%，企業(yè)科技人員是指直接從事研發(fā)和相關(guān)技術(shù)創(chuàng)新活動，以及專門從事上述活動的管理和提供直接技術(shù)服務的人員，包括在職、兼職和臨時聘用人員。

①科技人員工作時間

查看是否簽訂勞動合同，合同簽訂日期，確認當年是否超過180天。

②研發(fā)人員工作內(nèi)容

從研發(fā)人員名單中，抽取研發(fā)人員進行約談，包括詢問主要工作內(nèi)容、工作時間等。檢查研發(fā)人員學歷、崗位說明判斷是否與研發(fā)活動相關(guān)。

③科技人員占職工總數(shù)比例

核查企業(yè)花名冊、勞動合同、個稅和社保證明等，確認職工總數(shù)和科技人員數(shù)量占比是否符合要求。